Почему у вас не перемешивается вода в аккумуляторе?
Во время нагрева воды котлом и поступления ее в верхнюю часть аккумулятора она действительно не перемешивается с холодной водой в нижней части. Горячие слои так и остаются сверху. Такой алгоритм обеспечивается работой насоса в обвязке котла, который берет воду не из нижней части ТА, а по большей части с выхода регистров.
Сайт о кирпичных котлах с теплоаккумулятором:
http://samteplo.ru